蹲马桶后小腿疼是一种常见的症状，其病因可能与以下几个方面有关：

1. 长时间蹲姿造成的肌肉疲劳和酸痛

蹲马桶的姿势比较特殊，需要长时间保持蹲姿，容易造成小腿肌肉疲劳和酸痛。如果经常出现这种情况，建议采用合理的蹲姿和休息方式，减轻疲劳感。

2. 腿部循环不良引起的小腿疼痛

长时间保持蹲姿，可能影响到腿部的循环，导致小腿疼痛。建议蹲马桶时多换换姿势，使腿部得到充分的活动和休息，保持良好的血液循环。

3. 腿部肌肉、骨骼疾病引起的小腿疼痛

蹲马桶后小腿疼痛还可能与腿部肌肉、骨骼疾病有关。如腓肠肌综合症、跖骨骨髓炎等，这些疾病需要及时治疗，以免影响到健康。

4. 身体代谢异常引起的小腿疼痛

长期蹲马桶可能会影响身体代谢，导致小腿疼痛。这种情况可能需要进一步检查，了解身体的代谢状况，采取相应的治疗方法。

总之，蹲马桶后小腿疼痛可能与以上几个方面有关，需要根据具体情况进行综合分析和诊断，采取相应的治疗和预防措施。同时，应始终保持科学健康的生活方式，避免长时间保持不良姿势，保持良好的身心健康。