农村厕所的水箱水少主要有以下几个原因：

1. 地下水位低：农村地区的水资源大多来自地下水，但由于地下水位较低，采集水源受到限制，导致水箱水量不足。有些村庄的水井还因受到干旱、开采过度等因素而干涸，更加加重了农村用水不足的情况。

2. 水管老化：由于长期使用和管理不当，农村水管老化严重，水管损坏、渗漏，一定程度上影响了用水供应。一些老旧的农村水箱也存在着管路出现堵塞、漏水等问题，导致水箱水位下降。

3. 偷水盗水：由于农村缺乏法律意识和管理，一些村民会私自拦截水源，并在夜间偷水盗水，导致水源流失严重。这种偷盗行为不仅影响了正常用水，还会使其它村民的生活受到影响，导致水箱水量减少。

4. 农村用水浪费严重：一些村民缺乏用水意识，浪费情况严重。例如，很多人在刷牙、洗脸时不关水龙头，水一直流着；或者在农闲时挖沟排渠，随手开闸放水，都会导致农村用水浪费严重，水源减少。

5. 缺少水资源管理：由于一些农村缺乏对水资源的管理和计划使用，水资源得不到合理利用，造成了用水不足。如果农村缺乏科学地、有序地管理和利用水资源，水源枯竭、用水不足将无法得到根本解决，甚至可能会引发水源污染等问题。