马桶底部发黑是一个比较常见的问题，通常情况下，这种现象是由多种因素造成的。以下是可能导致马桶底部发黑的原因：

1.水质问题

一些地区的自来水中含有较高的含铁量，如果水质硬度过高，会导致水中的铁离子沉淀在马桶底部，从而使得底部出现黑色的斑点或腐蚀。

2.水垢和沉积物

如果使用的自来水中含有较高的钙和镁含量，这些矿物质会在水中形成硬度，形成水垢和沉积物，并且会在马桶底部和侧面形成黄色、棕色或黑色的腐蚀物。

3.厕所清洁不当

如果定期不进行清洁和消毒，马桶底部会逐渐沉积大量的细菌和细菌代谢物，形成一层黑色的细菌膜，难以清除。

4.旧马桶

如果马桶使用时间长，并且经常被消毒和浸泡在含氨的清洁剂中，底部橡胶密封圈和底部连接可能已经失去弹性，从而导致底部出现裂纹和泄漏，最终形成黑色的斑点。

5.废水管道问题

废水管道问题也可能导致底部黑色物质的形成。如果当地水管道老化或积累了过多的污垢，然后在废水管道内积累，导致底部产生黑色物质。

综上所述，马桶底部发黑可能是多种原因造成的。为有效预防这种现象，我们应该每周定期进行清洁，保证马桶内部卫生干净，使用少量的氯气清洁剂，并且使用可能存在水垢或硬度的水源时，使用过滤器或软水器。同时，也可以更换底部密封圈，并定期查看底部是否泄漏，并保持废水管道通畅。