马桶水箱老有水垢是由于水质硬度高、水中含有较多的有机物质，导致水中的钙、镁离子与有机物质反应而产生沉淀的一种现象。

普通的自来水中含有较高的钙、镁离子，当水中的钙、镁离子与盐酸反应时就会形成碳酸钙沉淀，这些沉淀物质就是水垢。

水垢不仅会影响马桶的美观度，还可以影响马桶的使用寿命和卫生条件。长时间不清理，累积的水垢会导致马桶的排水不畅或甚至完全不能排水，还会容易滋生细菌。同时，水箱中的水垢也会影响水的质量，使水中含有过多的杂质。

为了解决这个问题，我们可以采取以下措施：

1. 定期清洗马桶水箱。每隔一段时间，可以将水箱中的水泼出，然后使用刷子或酸性清洁剂清洗水箱内外部分，清除水垢和杂质。

2. 更换水质较好的自来水源。如果水质较硬，可以考虑更换自来水源，避免水中含有过多的钙、镁离子。

3. 安装水垢抑制器。市场上有专门的水垢抑制器，可以防止水垢的生成。这种产品可以在水管中使用，安装方便，价格也不贵。

综上所述，马桶水箱长期存在水垢问题不仅影响美观，还容易滋生细菌，要及时清理清洗。同时，我们也可以从水源、水垢抑制器等方面入手，预防水垢的生成。