如果马桶底部的水箱中有水，那么我们需要先明确一下，这个情况是否属于正常情况，还是因为某些原因引起的异常情况。

正常情况下，我们使用马桶时，每次冲水完毕，水箱中应该会留有一定量的水。这是因为，水箱中需要保存一定量的水，以便下一次使用马桶时，可以利用这些水来冲刷便盆。所以，如果马桶底部的水箱中有水，并且这些水并未影响马桶的正常使用，那么这种情况是属于正常情况中的一种。

不过，如果马桶底部的水箱中的水过多，或者这些水始终无法排出去，那么这种情况就属于异常情况。此时，我们需要检查一下马桶是否存在故障，并找到相应的解决方法。

以下是一些常见的马桶故障和应对措施：

1. 马桶闪池出现堵塞：如果马桶闪池因为便便、纸屑等原因出现了堵塞，就会导致水无法正常排出，从而产生底部水箱积水的情况。此时，我们可以使用通马桶等工具，或者使用某些化学品进行清洁。如果这些方法仍然无法解决问题，或者你不擅长处理这些问题，可以考虑请专业的水管工进行维修。

2. 水箱配件装配不当：有时候，水箱配件的安装装配可能不够紧密，或者有些配件松动，就会导致水箱中的水出现漏水现象。这种情况下，我们需要仔细检查一下水箱配件的安装，并进行必要的调整和紧固。

3. 水箱不平稳：如果马桶底部的水箱不平稳，水箱中的水就有可能无法正常流出。这时候，我们需要调整马桶的水平度，并对水箱的位置进行必要的调整。

总的来说，如果马桶底部的水箱出现水的情况，我们需要先确认一下是否属于正常情况，然后找到相应的原因并进行必要的处理。如果你不擅长处理这些问题，可以考虑请专业的水管工进行维修。