打通马桶最好的方法是采用专业的马桶疏通工具，例如马桶通、管道清洁机等。具体操作步骤如下：

1. 配备好必要的安全措施，如手套、口罩等。

2. 将马桶上的水放空，方法是关闭水阀门并冲水，使水尽可能地清除。

3. 如果水不流动了，需要靠手工清除淤物。使用尖头的扫帚、钩子、手摇排水器等工具，将马桶内部水平浮起的污物捞出来丢进一个桶里，避免堵塞下水道。

4. 如果淤物太严重，需要使用专业工具。比如马桶通，直接将它插入下水道，确保它能够到达阻塞处。将马桶通上移下动，直至阻塞处相通为止。如果使用马桶通无法解决问题，那么可以使用管道清洁机。将管道清洁机的管道末端插入马桶下水口，然后开机，让机器自动地清除阻塞物。

5. 清理完毕后，检查下水道是否畅通。将几加仑的水倒进马桶，看看水是否能够正常流走。反复测试几次，确保下水道畅通无阻。

总之，清理马桶不仅要耐心，更要有专业的工具和技术。如果阻塞太严重，不要自己尝试维修，最好找专业的管道清洁工人进行检测和解决。