新马桶水箱有疤，一般是因为制造或运输过程中受到了外力或摩擦而导致的。这些疤痕不仅影响美观，还可能导致漏水或其他使用问题。

首先，需要确认疤痕是否会导致漏水。如果疤痕很小，仅仅是表面的划痕，不会对水箱的密封性和结构造成影响，可以不必过于担心。但如果疤痕较深，或者疤痕所在的位置恰好是水箱的连接口、橡胶密封圈的位置等，就需要关注是否会漏水。如果怀疑有漏水隐患，可以在水箱上涂抹一层防水胶水来进行试验，如果出现漏水情况，就需要及时更换水箱或修补疤痕。

其次，如果疤痕影响美观，可以进行修复。新马桶水箱有疤可以用沙纸、砂纸或打磨机进行打磨，将疤痕处打磨平整。打磨之后再用同色的水箱修补墨水进行涂刷，尽量掌握涂刷的厚度和均匀性，等待一定时间之后即可再次使用。

最后，需要注意的是，在安装和日常使用过程中要注意避免对水箱造成外力或摩擦，避免对水箱造成损伤。另外，如果发现水箱的疤痕过多或者过于明显，建议及时更换全新的水箱，以确保家庭卫生和使用质量。