如果马桶底下不存水，那么首先应该检查一下马桶的内部结构是否有问题，比如水箱水位是否正常、进水孔是否堵塞等。如果都没有问题，那么有可能马桶下水管道堵塞了，这时候需要进行通管清理。

具体方法如下：

1. 准备好通管工具，可以是通管剂、通管拔、通管器等。

2. 把马桶里的水倒掉，将马桶底下的盖子打开，把马桶缸底下的水倒掉，用抹布把残留的水都擦干净。

3. 然后将通管工具插入马桶下的排水孔中，按照说明书的方法进行作业，如果是通管剂的话，可以倒入适量的剂量，等待一段时间，再放水冲洗。

4. 如果没有效果，可以试着使用通管拔或者通管器进行拉拔或者压缩管道。注意力度不要过大，以免损坏马桶或者管道。

5. 最后，把马桶盖子盖好，再次试着冲厕所，看看水情况是否已经恢复正常。

总之，马桶底下不存水可能是由各种原因造成的，我们需要仔细检查，找出问题所在，并且采取正确的方法进行清理。如果自己无法解决，可以请专业的修理工师进行维修。